Jakob Müller opiskeli prosessitekniikan pääaineenaan biotekniikka Hampurin teknillinen yliopisto. Osana tätä tutkimusta hän työharjoittelun kuusi kuukautta Evonik Goldschmidt Essenissä biotekniikan tutkimuksen jako.
Vuonna 2008 hän liittyi tutkijaryhmä professori Andreas Liese kuin PhD instituutin Tekniset Biokatalyysi Hampurin teknillinen yliopisto. Hänen työnsä käsitellään entsymaattisella tuotanto kosmeettisten komponenttien uuden reaktorin käsite. Pääpaino sijaitsee skaalata prosessin ja perustaa online-analytiikkaan.