Eugene analysoi viruksen ja kehittää moduulit ensimmäistä kertaa virus desinfiointi.
Sittemmin hän alkoi kerätä haittaohjelmia ja moduulit desinfiointi näiden virusten. Kokoelma tuli myöhemmin perusta antivirus tietokanta tunnetaan Kaspersky Antivirus. Tällä hetkellä tietokannassa on 1,3 miljoonaa levyä ja on yksi maailman kattavin virustorjunnan tietokantojen. Vuonna 1991, Eugene liittyi Yhdysvaltain tietotekniikan keskus, jossa Eugene ja kollegat ovat kehittäneet ryhmä AVP antivirus hankkeen, josta tuli perusmuoto Kaspersky Antivirus.
Maailman tunnustusta hankkeen vuonna 1994, jossa AVP ei tiedetä on voittanut kilpailun järjestämässä Hampurin yliopiston laboratoriokokeita, joka osoittaa, että virustentorjunnan korko on korkeampi kuin suosituin virustentorjuntaohjelmat tuolloin. Sitten, vuonna 1997, Eugene ja yhteistyön kumppani päätti perustaa itsenäinen yhtiö, josta myöhemmin tuli perustaja Kaspersky Labin. Sittemmin Eugene johtaa anti-virus tutkimusyritys. Kunnes lopulta vuonna 2007, on sijoitettu niin toimitusjohtajan Eugene Kaspersky Labin.