Tunnettu on yksi Aasian parhaista yliopisto.
Luultavasti paras yliopiston Filippiineillä mukaan monet lähde.
Ateneo de Manilla yliopisto aloitti vuonna 1859 kun Espanjan jesuiitat perustettiin Escuela Municipal de Manilla, julkinen peruskoulu perustettiin Intramuros kaupungille Manilla. Kuitenkin koulutuksen perinne Ateneo käsittää paljon vanhempi historia jesuiitat opetuksen järjestys Filippiineillä. Espanjan ensimmäinen jesuiitat saapuivat maahan 1581.
Vaikka ensisijaisesti lähetyssaarnaajia, he olivat myös huoltajat suhteen Studiorum, järjestelmä jesuiitta koulutuksen muotoiltu noin 1559 Vuonna 1590 he perustivat yksi ensimmäisistä korkeakoulujen Filippiineillä, Colegio de Manilla (tunnetaan myös Colegio Seminario de San Ignacio) johdolla Antonio Sedeño, SJ Koulu virallisesti avattiin vuonna 1595. Vuonna 1621, paavi Gregorius XV kautta arkkipiispa Manilla, valtuutti San Ignacio antaa astetta teologian ja taiteen.
Kaksi vuotta myöhemmin, kuningas Filip IV Espanja vahvisti tämän luvan, jolloin koulu kuninkaallinen ja Pontifical yliopisto, ensimmäinen yliopisto Filippiineillä ja Aasiassa. Kuitenkin puolivälissä 18-luvulla, katolinen siirtomaavallat, erityisesti Ranska, Portugali ja Espanja, oli kasvanut vihamielinen Society of Jesus. Siirtomaavallat lopulta karkottaa Society, usein melko julmasti, niiden ulottuvuuksissa. Jesuiitat jouduttiin luopumaan San Ignacio espanjalaisille siviiliviranomaisten vuonna 1768, heidän väkivaltainen karkottamiseen kaikkien Espanjan alueilta.
Lopuksi, painostuksesta katolinen royalty, Klemens XIV virallisesti julistettu purkamisesta Society Jeesuksen 1773. Pius VII uudelleen Society vuonna 1814, kun lähes seitsemän vuosikymmentä vainon ja yli neljän vuosikymmenen muodollista tukahduttaminen. Kuitenkin, jesuiitat ei palaa Filippiineille asti 1859, lähes vuosisadan jälkeen karkotusta. Lupa kuninkaan päätöksellä 1852, kymmenen Espanjan jesuiitat saapuivat Manilla 14. huhtikuuta 1859. Tämä jesuiittojen tehtävä lähetettiin pääasiassa lähetystyötä Mindanaon ja Jolo.
Huolimatta lähes vuosisadan päässä Filippiinit, jesuiitat mainetta kasvattajina pysyi juurtunut mielissä Manilla johtajat. 5. elokuuta, Ayuntamiento tai kaupunginvaltuusto pyysi kenraalikuvernööri varten jesuiitta koulu rahoittaa julkisin varoin.
Koska yliopisto, Ateneo de Manilla pyritään säilyttämään, laajentaa, ja kommunikoida totuus ja soveltaa sitä inhimillisen kehityksen ja ympäristön säilyttäminen.
filippiiniläinen ylio