Se alkaa Korkea Charity, mobiili pääkaupunki liiton, kanssa tutkimus ja rangaistus entisen ylikomentajan laivaston erityisesti oikeus-, komentaja Thel "Vadamee, jonka Hierachs, korkea profeetat Korkea neuvosto pitävät syyllistyneet suojella Sacred Ring tapahtumien aikana Halo: Combat Evolved.
"Vadamee sitten riisuttu hänen sijoitus ja merkkituotteiden kanssa Mark of Shame mukaan Tartaroksen, Chieftan on brutes
Tarina kääntyy sitten maapallon Orbital Defense Platform Kairo Station, jossa Spartan-117 vastaanottaa uuden Mjölner Mark VI panssari Mestarin tykistö kersantti Hän tapaa laivaston amiraali Terrence Hood palkintojenjakotilaisuudessa järjestetään kaksi tarkoituksiin myöntämistä ansiokkaasta teot ja parantaa moraali elossa väestön ja totesi kuin sotasankari (John-117 on jo saanut kaikki mitalit lukuun ottamatta "Prisoner of War" mitali).
Juhlat ovat pian keskeyttää Cortana raportointi "15 Covenant lippulaivoja holding asema aivan tappaa vyöhyke", signalointi alusta yleissopimuksen piiritys maapallon. YK: n turvallisuusneuvoston Marine voimat yhdessä Spartan-117 suojaavat asemalta hyökkääviä Covenant Naval Jalkaväki mutta muut asemat tuhosi Covenant. Lähetettyään pommi että liitto oli sijoitettu aluksen takaisin avaruuteen (tuhoten useita aluksia) hän laskeutui turvallisuusneuvoston aluksen ja sitten he suunnata maan pintaa New Mombasa taistella Covenant armeijan johtama korkean Profeetta pahoillani.
Kun Covenant hyökkäyksen voima pysähtyi turvallisuusneuvoston puolustuksemme, profeetta pahoillani pakenee Earth Miranda Keyes, kapteeni Keyes tytär, ja hänen irrallisuus pyrkiessään olevista in Amber Clas. Hätäisesti-ilmakehässä hypätä tuhosi kaupungin New Mombasa; tuhoaa Space Hissi ja sironta sen hylkyä mailia ympärillä.
Tarina kääntyy takaisin häpäissyt Sangheili komentaja, Thel "Vadamee, joka annetaan mahdollisuus lunastuksen korkean profeetat Totuuden ja Mercy ottaen ylös manttelin Arbiter sekä välitön kuolleisuus tehtävän.
Uusi Arbiter hyväksyy ja tulee tahtoa profeettojen, pyrkii täydentämään mahdoton tehtävän lunastusta hänen rikoksista. Thel "Vadamee tehtävänä on murha Heretic Leader, joka on pettyneitä yleissopimuksen tapahtumien jälkeen Asennus 04 jopa sen tuhoamista. Thel "Vadamee seuraa Heretic Leader koko kaasun kaivoksen (taistelee Heretics ja Flood) jos Heretics pakeni.
Kun Thel "Vadamee on vihdoin kohdata Heretic Leader," Refumee väittää uskovansa, että profeetat ovat valehdelleet Suuri Journey punctuating tämä tult