Nämä kaksi tekniikkaa ovat erittäin tärkeitä tunnistaa tuntemattomia kemiallisia yhdisteitä. Infrapuna-auttaa määritettäessä yhdisteen rakenne sijoittamalla tarkan sijainnin ja sen läsnä ollessa, erilaisten sidosten, kun taas Massaspektroskopia auttaa kemisti tunnistaa suhteellinen molekyylimassa yhdisteen. Molemmat tekniikat käytetään yhdessä voi auttaa kemisti tunnistaa tuntematon ratkaisu.
infrapuna teoksia altistamalla molekyyli säteilylle. Molekyylin sisällä on erilaisia joukkovelkakirjoja ja kunkin side on oma tärinän taajuus.
Esimerkiksi yksinkertainen sidos on eri tärinän taajuus kuin kaksoissidoksen. Joten kun kyseisiä joukkovelkakirjoja altistuvat säteilylle ne imevät energiat eri taajuuksilla. Siksi niiden värähtelytaajuus muuttuu ne imevät säteilyä ja tyypin mukaan Bond se on, se imee itseensä taajuuksia vain tietyissä alueilla. Tämä antaa IR-spektrit, jotka voidaan tulkita osoittaa, kuinka monta eri sidoksia läsnä molekyylejä. Tämä tarjoaa tietoa funktionaalisten ryhmien molekyylin ja miten ne ovat sitoutuneet.
Tämä tekniikka on arvokas erottaa yhdisteitä, kuten alkoholeja, karboksyylihappoja, estereitä ja karbonyylien.
Massaspektroskopia toimii rikkomalla molekyyli pieniksi paloiksi. Kukin fragmentti punnitaan ja runsaasti kunkin fragmentin näkyy. Nämä fragmentit laittaa takaisin yhdessä antaa kokonaismassa alkuperäisen molekyylin. Molekyylit höyrystyvät ja sitten pommitetaan elektronitykki. Tämä elektronitykki koputtaa pois elektronin atomien molekyylin ja ionisoi niitä. Nämä ionit kiihdytetään sähkökentän sitten johdetaan magneettikentän, jossa ne taipuvat niiden massa.
Raskaat ionit kanssa matkustaa pienellä nopeudella eikä taipumaan niin paljon. Nämä ionit sitten havaitaan ja spektri tuotetaan huiput ionin palasia. Spektri osoittaa massan suhde varaukseen kunkin fragmentin ja miten runsas kukin fragmentti tuotetaan. Tämä massaspektri käytetään selvittää suhteellinen moolimassa yhdistettä.